石牛寨国家地质公园自2006年批准建立省级地质公园以来，平江县委、县政府采取了一系列的保护管理措施，致使石牛寨国家地质公园地质遗迹资源得到了有效的保护，石牛寨国家地质公园生态环境也得到了明显的改善。石牛寨国家地质公园采取的主要保护措施如下：
（1）成立湖南平江石牛寨地质公园管理处，具体负责石牛寨国家地质公园地质遗迹保护和建设管理，人员编制60人，其中技术人员25人（含地质科技人员12人）。
（2）进行石牛寨国家地质公园地质遗迹保护规划，明确划定石牛寨国家地质公园的一、二、三级保护区和外围保护区，严格按照各级保护要求进行石牛寨国家地质公园建设和管理，严格按照“保护第一，开发第二“的原则进行开发利用。
（3）针对石牛寨国家地质公园内的人口和社会发展压力，一方面对石牛寨国家地质公园内居民进行转产，通过发展旅游产业、观光果园、生态农业等方式改变传统农业结构，提高人民的生活水平；另一方面，从长远考虑，对少数影响石牛寨国家地质公园生态环境及地貌景观的村庄逐步搬迁。
（4）建设必要的石牛寨国家地质公园地质遗迹及生态环境保护工程，如对石牛寨国家地质公园重要的濒危地质遗迹景点设置保护围栏，布设卫生、环保、清洁设施等。
